疾控中心实验室是一个设施齐全，功能完备，智能化程度较高，有高度的安全保护措施的新医疗建筑。从其进出的人、材、物都要满足生物安全标准的要求，排出的空气（气体）、水（液体）、废弃物和垃圾都要达到劳动保护和环境保护要求。实验室的试验品和产成品要严格登记备案，要有专门的库房和车辆，库房要与实验室连成一体，车辆要专车专用，并且达到生物安全标准的要求。 以下为其设计理念：
（1）确认实验室内的物理控制对产品、环境和操作人员的保护作用；
（2）确定洁净区、非洁净区、污染区和半污染区，以及连带辅助区的功能和用途；
（3）确定需要封闭或不需要封闭的操作区域；
（4）确定一次屏障、二次屏障的净化控制方法；
（5）试验和化验要合理的分开；
（6）暖通空调、真空、压缩空气、供水系统、消毒灭菌要符合GMP要求；
（7）确定不同区域的气流流向和流速；
（8）确定原材料、设备、产品和生物废料的流向；
（9）满足“三废”排放标准；
（10）确定人员，特别是关键实验操作人员的流向和控制；
（11）确定防止潜在危害物质释放的措施；
（12）突发性“故障”的紧急关闭和自救方案；
（13）防火、保卫设施；
（14）备用：电源、通讯、控制设施。
